DNA條形碼：讓中藥材鑒定擺脫經(jīng)驗(yàn)依賴
作者：人民資訊 來源:百家號 2021-8-27 
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陳士林認(rèn)為，相比傳統(tǒng)的中藥材鑒定方法，中藥材DNA條形碼鑒定技術(shù)具有多方面優(yōu)勢。
“該技術(shù)具有通用性，只需選用一個或少數(shù)幾個基因片段即可對絕大部分物種進(jìn)行準(zhǔn)確鑒定；鑒定過程更加快速；重復(fù)性和穩(wěn)定性高；實(shí)驗(yàn)過程標(biāo)準(zhǔn)、操作簡單；可通過互聯(lián)網(wǎng)和信息平臺對現(xiàn)有物種序列信息進(jìn)行集中統(tǒng)一管理；可有效緩解分類鑒定人才缺乏的現(xiàn)狀�！标愂苛终f。
近年來，DNA條形碼鑒定技術(shù)在中藥材鑒定中已得到成功應(yīng)用，擺脫了傳統(tǒng)形態(tài)鑒定方法依賴長期經(jīng)驗(yàn)的束縛。陳士林強(qiáng)調(diào)，該技術(shù)有利于標(biāo)準(zhǔn)化，是中藥分子鑒定方法學(xué)上的創(chuàng)新。
不過，這項(xiàng)鑒定技術(shù)也存在短板。陳士林解釋：“由于DNA條形碼鑒定技術(shù)主要在核酸層面對物種進(jìn)行鑒定，不包含物種的性狀和物理化學(xué)質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)信息。所以，對于在炮制或加工過程中DNA降解的藥材鑒定能力有限。另外，DNA條形碼不能鑒定礦物藥材�！�
讓中藥材鑒定更趨標(biāo)準(zhǔn)化
近年來，國內(nèi)相關(guān)團(tuán)隊(duì)正在推動中藥材DNA條形碼鑒定技術(shù)體系的建立。
比如，陳士林本草基因組學(xué)團(tuán)隊(duì)在大樣本量中藥材基因序列篩選研究基礎(chǔ)上，出版了《中國藥典中藥材DNA條形碼標(biāo)準(zhǔn)序列》和《中藥DNA條形碼分子鑒定》，建立了中藥材DNA條形碼分子鑒定體系。
“該體系包括以ITS2+psbA-trnH為主體的植物類藥材DNA條形碼鑒定體系和COI+ITS2的動物類藥材DNA條形碼鑒定體系�！标愂苛纸榻B。
2010年，陳士林團(tuán)隊(duì)比較了7個候選DNA條形碼，篩選的標(biāo)準(zhǔn)包括PCR擴(kuò)增效率、種內(nèi)/種間遺傳變異等。通過對7個門753個屬4800個物種6600多個樣品的ITS2序列鑒定能力進(jìn)行分析，顯示ITS2在物種水平的鑒定效率高達(dá)92.7%。
因此，陳士林團(tuán)隊(duì)建議將ITS2作為藥用植物標(biāo)準(zhǔn)DNA條形碼，同時(shí)建議ITS2可作為新的通用條形碼用于鑒定更廣泛的植物類群。2011年，中國DNA條形碼植物工作組對來自75科141屬1757物種6286樣本的4個DNA條形碼進(jìn)行研究，建議把ITS/ITS2作為種子植物的核心條形碼。
為了保證鑒定結(jié)果的準(zhǔn)確性，陳士林團(tuán)隊(duì)還建立了DNA條形碼數(shù)據(jù)庫。DNA條形碼數(shù)據(jù)庫不僅是存儲樣品信息和DNA條形碼序列的工具，而且是DNA條形碼研究和物種鑒定分析的生物信息學(xué)平臺，對推進(jìn)中藥材鑒定方法通用化、標(biāo)準(zhǔn)化和國際化具有重要作用。
在研究基礎(chǔ)上，陳士林團(tuán)隊(duì)建立了中藥材DNA條形碼鑒定系統(tǒng)，核心數(shù)據(jù)庫涵蓋了《中國藥典》（2010年版，2015年版）收錄的幾乎所有動物、植物藥材及常見混偽品，并包含了《韓國藥典》《日本藥局方》《印度藥典》《歐洲藥典》以及《美國藥典》所記錄的草藥藥材，擴(kuò)展數(shù)據(jù)庫中涵蓋的物種數(shù)超過十萬種，序列超過百萬條。
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